NBISweden / AGAT

80%

master: 57%

LAST BUILD ON BRANCH gtf

branch: gtf

CHANGE BRANCH

x

Reset

• gtf
• 0.2.0
• 110
• 117
• 122
• 135
• 181
• 190bisbis
• 192
• 193
• 193bis
• 195
• 207
• 221
• 225
• 242
• 245
• 246
• 248
• 260
• 290
• 297
• 300
• 315
• 325
• 327
• 329
• 347
• 350
• 352
• 363
• 368
• 383
• 389
• 3rdcol
• 3rdcoldebug
• 401
• 411
• 420
• 424
• 426
• 441_GTF_transcript_id
• 445
• 448
• 456
• 457
• 458
• 471
• 477
• 47bis
• 484
• 507
• 512
• 516
• 528
• 550
• 556
• 94
• Juke34-patch-1
• V1.4.0
• add_ENA_compliant_script
• aersoares81-patch-1
• agat_sp_compare_two_annotations_435
• agat_sp_fix_features_locations_duplicated
• agat_sp_manage_functional_annotation
• augustus
• badge
• bar
• case33
• cleanL1
• cleanclone
• compare_two_annotations
• config
• cover
• cover2
• coveralls
• damian
• dep
• doc
• docagain
• docl3
• docs
• edta
• ena
• extract
• fasta
• feature/fixorf
• feature/flagstop
• feature/killlist
• few
• filter
• fix-doc-mispelling
• fixes
• id
• improve
• improve_embl2gff
• improve_help
• intergenic
• intronless
• keeplist
• kira
• l1standalone
• main
• manage_function_436
• mask
• master
• merge
• mfannot
• mkdocs
• operator
• osx_zcat
• parallel
• patch-1
• perl
• readme
• readthedocs
• rendering
• separate
• sharedir
• sort
• speed
• speedup
• speedup_l3
• splice
• splitstop
• stat
• statistics
• stop
• tabix
• tempdirtiny
• tsv
• uid
• update
• update-readme-doc
• update_doc
• utr
• v.0.9.0
• v.0.9.2
• v0.0.2
• v0.0.3
• v0.1.0
• v0.1.1
• v0.2.0
• v0.2.1
• v0.2.2
• v0.2.2bis
• v0.2.3
• v0.3.0
• v0.4.0
• v0.5.0
• v0.5.1
• v0.6.0
• v0.6.1
• v0.6.2
• v0.8.1
• v0.9.0
• v0.9.1
• v0.9.2
• v1.0.0
• v1.1.0
• v1.2.0
• v1.3.0
• v1.3.1
• v1.3.2
• v1.3.3
• v1.4.0
• v1.4.1
• v1.4.2
• v1.5.0
• v1.5.1
• v1.6.0
• v1.6.1
• version
• version_display

Build # 328

Build Type

push

travis-ci

Committed by Juke34

Commit Message

Fix gtf2gff converter to remove cds in special cases - add tests for gtf to gff conversion and for gff to gff to check stop codon when starting an exon or split over 2 exons

Run Details

9252 of 11627 relevant lines covered (79.57%)

8204.29 hits per line